Imaginez qu’il existe des êtres vivants qui sont a la base de l’existence même et que ces être vivants ne peuvent être vus que par certains humains. Il peuvent prendre toutes les formes possibles et peuvent entrer en contacte avec les humains pour leur nuire ou pour leur garantir des pouvoirs surnaturels, Ces bestioles s’appellent les Mushi et certains hommes qui parviennent a les distinguer essaient de les étudier : ont les appelle les Mushishi.
C’est le cas de Ginko qui voyage a travers le japon pour dépanner certaines personne qui entre en contacte avec ces msuhi qui leur pose problème.